1、隐睾症和腹股沟斜疝：隐睾症和腹股沟斜疝是尿道下裂最常见的并发症，发病率在10%左右，临床上发现，尿道的开口越是靠近阴囊，发生的几率就会越高。
2、尿路畸形：尿路畸形是男性后型尿道下列者常见的并发症，发病率一般在1%—5%，如果合并其他系统畸形的话，发病率会更高，如果合并其他一个系统畸形的发病率在7%左右，两个的话是在13%左右，三个在37%。
3、前列腺囊：前列腺囊主要是男性朋友们在胚胎发育的过程中因为苗勒管的抑制不全或者是尿生殖男性化不全导致的，一般在男性后型尿道下裂患者中的发病率在10%—15%左右，专家指出，前列腺囊会给尿路造成阻塞，囊内会有结石和感染。
4、两性畸形：如果男性朋友们有严重的尿道下裂的话，比如说，合并外生殖器的性别特征模糊，睾丸下降不全、阴茎小、阴囊分裂等症状的话，需要注意两性畸形的发生，患者朋友们要及时到正规的医院接受染色体检查和一些相关的内分泌功能检查，临床上有少数患者还会并发肛门闭锁、脊膜膨出等疾病。